本項目的始由是在2004年大埔林村鍾屋村的村民向香港漁農自然護理署(漁護署)作出投訴，了解情況後由本園展開行動。

村民投訴村內一幢祖屋被約80隻大蹄蝠(Hipposideros armiger)佔據。這種大型蟲食性蝙蝠經常棲息於舊建築物。漁農署接報後聯絡本園和要求協助和提供意見，以便與村民會面。。根據香港法律，所有蝙蝠均為受保護動物，因此我們希望提高大眾保育意識，嘗試尋求理想及友善的方案來解決衝突。

村民認為蝙蝠會帶來噩運，而屋內的蝙蝠糞堆積會發出難聞氣味。本園動物保育人員答應能定期清理堆積的糞便，並解說糞便是上佳的肥料。而這種蝙蝠每隻每晚能捕食數以千計的昆蟲，包括蚊子，而且不會襲擊人類或吸血。我們還向村民講述蝙蝠在中國文化中是祥瑞的象徵，喻意好運多福，跟村民描述的負面形象迥然不同。

當我們到過現場了解實況後，動物保育部聯同永續生活及農業部和教育部商討並考慮展開跨部門合作，嘗試平息當前矛盾和為蝙蝠與人類之間的衝突尋求長遠解決方案。

此計劃於2005年擬定的項目主要目標如下：

1. 提高村民對本地生物多樣性及蝙蝠是受法例保護的意識
2. 藉着農業和文化措施處理衝突
3. 建立友誼和互信，並與林村谷的鄰人友鄰合作的的良好榜樣
4. 保護到野生蝙蝠

自2005年起，工作人員及義工先後探討超過100次，清理屋內蝙蝠糞和點算蝙蝠數目。本園工程及設施部亦協助村民進行簡單的房屋維修。

此期間，點算所得的蝙蝠數目由0至196隻不等。蝙蝠會隨季節遷移，在秋冬旱季時會遷到較潮濕的水道，而在三月中旬回暖後返回舊村屋。我們的長遠目標是開發永續項目，並鼓勵村民參與，讓他們擔任蝙蝠和蝙蝠糞的監護人。

本園農場小賣店有售賣蝙蝠糞，而所得收益用於建築修護。

蝙蝠在香港受法例保護，如非事前獲漁護署署長批准，任何人士均不可干擾或進行蝙蝠研究。

按此觀看有關林村社區蝙蝠計劃的短片。